Do celów Międzynarodowego Ośrodka Badań Interdyscyplinarnych należą:
· rozwój regionalny, zwłaszcza terenów wiejskich, oparty na zasadzie zrównoważonego rozwoju
· współpraca regionów przygranicznych w Europie, szczególnie w basenie Morza Bałtyckiego
· umacnianie społeczeństwa obywatelskiego, oparte w szczególności na zasadzie równości wobec prawa, niedyskryminacji i świadomym udziale obywateli w życiu publicznym
· badanie i poszukiwanie systemowych rozwiązań dla problemów migracji w perspektywie współczesnej i historycznej
· rozwój transgranicznej i interdyscyplinarnej współpracy naukowej, a także obejmującej kształcenie oparte na idei lifelong learning.
Zadania te będą realizowane poprzez:
· rozwój i przeprowadzenie projektów naukowych w perspektywie współpracy interdyscyplinarnej, szczególnie, ale nie wyłącznie w ramach nauk społecznych i humanistycznych
· organizowanie konferencji, seminariów, warsztatów, szkół letnich, wycieczek edukacyjnych, debat, wydarzeń kulturalnych i artystycznych.
MOBI jest otwarte na wymianę doświadczeń i kontakty oraz współpracę z międzynarodowymi i regionalnymi, lokalnymi instytucjami naukowymi, organizacjami pozarządowymi, samorządami, kulturalnymi i edukacyjnymi.